Dues complicacions molt diferents que sense dubte guarden molta relació. Molts celíacs presenten també intolerància a la lactosa, tot i que la incidència de la intolerància a la lactosa és molt més gran que la malaltia celíaca, aconseguint la xifra del 30% de la població espanyola, en comparació amb l’1% de celíacs diagnosticats que hi ha a Espanya.

Una persona amb celiaquia que no està tractant la infecció amb una dieta lliure de gluten (per no estar diagnosticat/da), té més probabilitats de desenvolupar una deficiència de lactasa i ser intolerant a la lactosa. Això es deu al fet que la lactosa es produeix a la mucosa de l’intestí prim, la part de l’intestí que pateix danys en una persona amb celiaquia no tractada. Les dues condicions també poden produir símptomes externs similars, com diarrea, inflor i recargolaments estomacals.